Kolégium rektora EU v Bratislave je stálym poradným orgánom rektora. Členmi kolégia rektora sú: rektor, prorektori, dekani, kvestor, predseda AS EU v Bratislave, zástupca odborov, zástupca študentského parlamentu a ďalší podľa rozhodnutia rektora.
Členovia kolégia rektora
DAŇO, Ferdinand, prof. Ing., PhD., rektor
JUHÁSZOVÁ, Zuzana, doc. Mgr. Ing., PhD., prorektorka pre vzdelávanie
PÉLIOVÁ, Jana, doc. Ing., PhD., prorektorka pre akreditáciu a kvalitu
MATTOŠ, Boris, doc. Mgr., PhD., prorektor pre medzinárodné vzťahy
KINTLER, Jakub, Ing. PhD., prorektor pre rozvoj, kultúru a šport
PUŠKÁROVÁ, Paula, doc. Ing., DiS. art., PhD., prorektorka pre vedu a doktorandské štúdium
PASTORÁKOVÁ, Erika, prof. Ing., PhD., dekanka Národohospodárskej fakulty
DRÁBIK, Peter, doc. Ing., PhD., MSc. dekan Obchodnej fakulty
ŠOLTÉS, Erik, prof. Mgr., PhD., dekan Fakulty hospodárskej informatiky
ROMANOVÁ, Anita, doc. Ing., PhD., dekanka Fakulty podnikového manažmentu
KUCHARČÍK, Rudolf, doc. PhDr., PhD., dekan Fakulty medzinárodných vzťahov
ŠTEFANČÍK, Radoslav, doc. PhDr., MPol., PhD., dekan Fakulty aplikovaných jazykov
TKÁČ, Michal, Dr. h. c. prof. RNDr., CSc., dekan Podnikovohospodárskej fakulty so sídlom v Košiciach
DZIUROVÁ, Mária, Ing., kvestorka
KAŠŤÁKOVÁ, Elena, doc. Mgr., PhD., poverená výkonom funkcie predsedníčky Rady ZO OZ PŠaV
MAJDÚCHOVÁ, Helena, prof. Ing., CSc., predsedníčka Akademického senátu EU v Bratislave
HÁMOROVÁ, Tamara, prezidentka Študentského parlamentu